El servicio de análisis de imágenes permite a los investigadores obtener datos cuantitativos (números, áreas, duración en tiempo, etc) y cualitativos (forma, textura, etc) de imágenes de microscopía en luz transmitida y fluorescencia. El servicio se basa en la elaboración de protocolos para el tratamiento de imágenes y cuantificación semi-automatizada utilizando diversos software, de acuerdo a los estándares establecidos en revistas de publicación científica de alto impacto.
El servicio de análisis de imágenes incluye:
- Reunión inicial con el investigador para conocer detalles de la muestra, imágenes adquiridas y señal de interés. Evaluación de imágenes de prueba y establecimiento del objetivo (análisis de imágenes, cuantificación, edición, elaboración de macro, etc.)
- El analista desarrolla un protocolo con el software mas adecuado para obtener los datos estipulados por el investigador.
- Reunión con el investigador para aclarar protocolo y realizar correcciones si es pertinente.
- El analista recibe la biblioteca de imágenes y realiza el análisis de acuerdo al protocolo establecido.
- Entrega de informe al investigador, que detalla el protocolo y los datos obtenidos del proceso (imágenes, tablas o gráficos).
Computador | DELL Precision T5500 |
Sistema Operativo | Windows 7 Professional Edition 64-bit |
Procesador | Intel Xeon CPU 2.40GHz (dos procesadores) |
Memoria RAM | 12 GB |
Tarjeta de video | NVIDIA Quadro 4000 |
Pantalla | DELL UltraSharp 27’’ |
Software | StereoInvestigator (MBF) Version 11.07 |
Modulo Virtual Image | |
Modulo Image Stack | |
MetaFluor (Molecular Probes) | Version 7.8.6.0 |
Metamorph Advanced for Olympus (Molecular Probes) | Version 7.8.6.0 |
Metamorph NX (Molecular Probes) | Version 2.5.1063.2 |
Densita (MBF) | Version 3.42 |
Cell Profiler | Version 2.1.1 |
Ilasytik | Version 1.1.9 |
Vaaa3D (3D Visualization-assisted analysis) | Version 3.1 |
ImageJ - Fiji | Actualizado a su mas reciente versión |
El servicio de análisis permite la extracción de información significativa desde sus imágenes adquiridas con equipos de microscopia. Las aplicaciones incluyen pero no se limitan a:
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Edición de imágenes para publicaciones de acuerdo a los estándares de revistas de alto impacto (Nature, JCB).
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Cuantificacion de eventos en timelapse o z-stack: numero de células, numero de partículas, tamaño, área, longitud.
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Deconvolución de imágenes.
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Estudio de porcentaje de colocalizción de marca (de imágenes adquiridas con microscopios confocales)
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Generación de perfiles de intensidad de fluorescencia.
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Unión de imágenes seriadas.
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Generaciones de score a partir de controles positivos y negativos de una señal de interés.
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Elaboracion de videos timelapse.
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Seguimiento del cambio de forma o tamaño de una particula.
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Reconstruccion 3D.
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Esqueletonizacion y binarizacion de imágenes.