Servicio de Analisis de Imágenes

El servicio de análisis de imágenes permite a los investigadores obtener datos cuantitativos (números, áreas, duración en tiempo, etc) y cualitativos (forma, textura, etc) de imágenes de microscopía en luz transmitida y fluorescencia. El servicio se basa en la elaboración de protocolos para el tratamiento de imágenes y cuantificación semi-automatizada utilizando diversos software, de acuerdo a los estándares establecidos en revistas de publicación científica de alto impacto.

El servicio de análisis de imágenes incluye:

  • Reunión inicial con el investigador para conocer detalles de la muestra, imágenes adquiridas y señal de interés.  Evaluación de imágenes de prueba y establecimiento del objetivo (análisis de imágenes, cuantificación, edición, elaboración de macro, etc.)
  • El analista desarrolla un protocolo con el software mas adecuado para obtener los datos estipulados por el investigador.
  • Reunión con el investigador para aclarar protocolo y realizar correcciones si es pertinente.
  • El analista recibe la biblioteca de imágenes y realiza el análisis de acuerdo al protocolo establecido.
  • Entrega de informe al investigador, que detalla el protocolo y los datos obtenidos del proceso (imágenes, tablas o gráficos).

Computador DELL Precision T5500
Sistema Operativo Windows 7 Professional Edition 64-bit
Procesador Intel Xeon CPU 2.40GHz (dos procesadores)
Memoria RAM 12 GB
Tarjeta de video NVIDIA Quadro 4000
Pantalla DELL UltraSharp 27’’
Software StereoInvestigator (MBF) Version 11.07
Modulo Virtual Image
Modulo Image Stack
MetaFluor (Molecular Probes) Version 7.8.6.0
Metamorph Advanced for Olympus (Molecular Probes) Version 7.8.6.0
Metamorph NX (Molecular Probes) Version 2.5.1063.2
Densita (MBF) Version 3.42
Cell Profiler Version 2.1.1
Ilasytik Version 1.1.9
Vaaa3D (3D Visualization-assisted analysis) Version 3.1
ImageJ - Fiji Actualizado a su mas reciente versión

El servicio de análisis permite la extracción de información significativa desde sus imágenes adquiridas con equipos de microscopia. Las aplicaciones incluyen pero no se limitan a:

  • Edición de imágenes para publicaciones de acuerdo a los estándares de revistas de alto impacto (Nature, JCB).

  • Cuantificacion de eventos en timelapse o z-stack: numero de células, numero de partículas, tamaño, área, longitud.

  • Deconvolución de imágenes.

  • Estudio de porcentaje de colocalizción de marca (de imágenes adquiridas con microscopios confocales)

  • Generación de perfiles de intensidad de fluorescencia.

  • Unión de imágenes seriadas.

  • Generaciones de score a partir de controles positivos y negativos de una señal de interés.

  • Elaboracion de videos timelapse.

  • Seguimiento del cambio de forma o tamaño de una particula.

  • Reconstruccion 3D.

  • Esqueletonizacion y binarizacion de imágenes.